Mécanismes d'assemblage des corps nucléaires PML et ciblage thérapeutique par l'arsenic - Collège de France
Thèse Année : 2023

Mechanisms of PML nuclear body formation and therapeutic targeting by arsenic

Mécanismes d'assemblage des corps nucléaires PML et ciblage thérapeutique par l'arsenic

Pierre Bercier
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1481674
  • IdRef : 282294023

Résumé

PML (ProMyelocytic Leukemia) is the sole organizer of membrane-less organelles: the PML nuclear bodies (NBs). NBs recruit a wide variety of partner proteins and control their post-translational modifications, in particular their sumoylation, regulating their activity. The PML protein plays versatile roles in biological processes including senescence, apoptosis and metabolism, but the implication of NB formation in these processes remain elusive. PML NBs are disorganized in acute promyelocytic leukemia (APL) where a chromosomal translocation between PML and RARα leads to the production of the PML/RARα oncoprotein. A combination treatment of arsenic and retinoic acid induces APL cure without additional chemotherapy. Critically, arsenic can directly bind to PML and induce NB reformation and subsequent senescence activation, leading to the loss of leukemic stem cell self-renewing activity, responsible for APL cure. However, the mechanism by which arsenic binding onto PML induces NB assembly remains unknown. NBs are lost in other kinds of cancers and PML is involved in some neurodegenerative diseases, making it an interesting therapeutic target. During my PhD. I aimed at identifying the mechanisms underlying PML NB assembly, in particular upon arsenic treatment, and deciphering the link between NB formation and their biochemical functions. Our results show that NBs assembly follow some hallmarks of membrane-less organelles formed through liquid liquid phase separation but display some specificities like a highly organized core-shell structure. We focused on the B2 domain of PML, which is found mutated in arsenic-resistant APL patients and revealed its central role in basal PML NB assembly dynamics. Using various technical approaches and expertise, we determined that this domain controls PML dynamics at NBs through the formation of a homo-trimer. These multimers are coordinated by weak and reversible hydrophobic interactions between alpha-helixes in the B2 domain. Moreover, these interactions regroup three free cysteine residues at the core of the trimer which play a central role in controlling the assembly dynamics of NBs. Arsenic targets this cysteine triad, transforming weak transient interactions into covalent ones. This immobilizes B2 monomers in a trimeric conformation and induces a liquid-like to gel-like transition of NBs. Preliminary data suggest that arsenic-induced loss of self-renewing activity in cells transformed by PML/RARα may also depend on this cysteine triad. Thereby, linking stereo-selectivity and intracellular dynamic, we solved the first step of the mechanism by which arsenic induces NB formation. These results pave the way for the development of new structure-based activators, which mimic arsenic and activate NB assembly. By collaborating on the development of artificial NBs in cellulo, where we can fine-tune assembly/disassembly by LLPS, we aim to interrogate the link between the core-shell structure of PML NBs, their dynamic assembly and their biochemical functions, in particular sumoylation and degradation of partner proteins. This project also gives new insights in the understanding of NB biogenesis' regulation by redox reactions. Overall, this project opens up new perspectives for the development of new therapeutic strategies in which the formation of NB and/or its degradation can improve the therapeutic outcome.
PML (ProMyelocytic Leukemia) est une protéine qui structure la coque d'organelles sans membranes, nommés corps nucléaires PML (CNP). Les CNP recrutent un grand nombre de protéines partenaires et contrôlent leurs modifications post-traductionnelles, en particulier leur sumoylation, régulant leur activité. La protéine PML est impliquée dans de nombreux processus biologiques, en particulier la sénescence, l'apoptose ou le métabolisme, mais le rôle des CNP en tant que tels reste à démontrer. Les CNP sont désorganisés par l'action de l'oncoprotéine PML/RARa dans un type de leucémie rare, la leucémie aiguë promyélocytaire (LAP). La combinaison d'acide rétinoïque et de trioxyde d'arsenic guérit les malades, sans chimiothérapie additionnelle. De façon déterminante, l'arsenic peut se lier directement à PML, induire le réassemblage des CNP et l'activation d'un programme de sénescence, bloquant l'auto-renouvèlement des cellules leucémiques et conduisant à la guérison des patients. Cependant, le mécanisme par lequel la liaison de l'arsenic sur PML provoque cet assemblage demeure inconnu. Les CNP sont également perdus dans d'autres cancers et PML est impliquée dans certaines maladies neurodégénératives, ce qui en fait une cible thérapeutique de choix. Au cours de ma thèse, j'ai cherché à identifier les mécanismes régulant l'assemblage des CNP, en particulier en réponse à l'arsenic, et le lien entre la dynamique d'assemblage des CNP et leur fonction. Les résultats que j'ai obtenus indiquent que les CNP présentent des caractéristiques d'organelles sans membrane s'assemblant selon un processus de séparation de phase liquide-liquide, mais avec certaines spécificités, comme celle d'être très structurés en core-shell. L'étude d'un domaine doigt de zinc de PML, la boite B2, retrouvé muté chez les patients LAP résistants à l'arsenic, a révélé son rôle central dans la dynamique d'assemblage des CNP. Mon travail de thèse a permis de montrer, par différentes techniques et expertises que la boite B2 contrôle l'assemblage dynamique des CNP en formant des homo-trimères. Ces derniers sont coordonnés par des interactions, de type hydrophobe, faibles et réversibles grâce à une hélice α présente dans ce domaine. En outre, ces interactions positionnent au cœur du trimère une cystéine libre de l'hélice qui joue une rôle central en contrôlant la dynamique d'assemblage des CNP. C'est sur cette triade de cystéines accessibles que l'arsenic vient se loger, transformant des liaisons faibles en liaisons covalentes. L'arsenic fige ainsi les trimères de boite B2, induisant une transition de phase des CNP vers des caractéristiques de type gel. Des résultats préliminaires montrent que la perte de l'auto-renouvèlement des cellules transformées par l'oncoprotéine PML-RARα induit par l'arsenic dépend de cette triade de cystéine. Ainsi, en reliant stéréo-sélectivité et dynamique intracellulaire, nous avons élucidé la toute première étape du mécanisme d'action ciblée de l'arsenic sur PML, ouvrant la voie au développement clinique de nouvelles molécules, basé sur la structure, pour activer de la biogenèse des CNP. En collaborant au développement de corps nucléaires PML artificiels in cellulo, dont nous pouvons contrôler l'assemblage par séparation de phase liquide-liquide, nous cherchons à comprendre par des approches ascendantes les liens entre la structure en core-shell des CNP, leur dynamique d'assemblage et leurs fonctions de sumoylation/dégradation. Mon travail de thèse ouvre également de nouvelles perspectives pour comprendre comment les réactions redox régulent la biogenèse des CNP. L'ensemble de ces travaux présente un intérêt pour la mise au point de nouvelles thérapeutiques où l'induction de la formation des CNP et/ou de leur dégradation peut améliorer le pronostic.
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Origine Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

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  • HAL Id : tel-04850925 , version 1

Citer

Pierre Bercier. Mécanismes d'assemblage des corps nucléaires PML et ciblage thérapeutique par l'arsenic. Médecine humaine et pathologie. Université Paris Cité, 2023. Français. ⟨NNT : 2023UNIP5035⟩. ⟨tel-04850925⟩
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